宇土から今日の停泊地である野母崎までは島原半島を交わしてすぐなので、
Tracking Map ホクレア アリンガノ・マイス 2007年航海
ルート上に幾つも候補があるわけではないのですが、私の予想はここですね。野母崎にある熊野神社。
http://www.nomozakituushin.com/nomozaki-yurai.html
熊野神そのものは航海神ではないのですが、野母崎の漁師の信仰を集めていたというし、ポリネシア航海協会のブログではfishing shrineと書いてますからね。ちなみにこの熊野神社の摂社として非常に興味深い神社があります。日ノ山神社。祭神は何と中国南部の航海女神である媽祖。
http://www.nomozakituushin.com/shrine-hinoyama/index.html
ただ、この縁起はおかしいんですよ。媽祖というのは10世紀後半の福建省に実在した女性です。だから9世紀中盤に長崎の人が媽祖を夢に見るわけがない。きっと後世に縁起を考えた時に、媽祖を古代から存在した神だと思っちゃったのでしょうね。